เมื่อวันที่ 16 กันยายน 2563 ผู้ตัดสิน และ นักฟุตบอลหญิง และบุคลากรที่เกี่ยวข้องกับการแข่งขัน ฟุตบอลหญิง ไทย วีเมนส์ ลีก เข้าตรวจหาเชื้อโควิด-19 เพื่อให้ สอดคล้องกับนโยบาย กระทรวงการท่องเที่ยวและกีฬา ตามมาตรการผ่อนปรนกิจการ และ กิจกรรมด้านการกีฬา เพื่อป้องกันการแพร่ระบาดของโรคโควิด-19

การตรวจหาเชื้อดังกล่าวเป็นความร่วมมือกันระหว่าง กระทรวงสาธารณสุข โดยกรมวิทยาศาสตร์การแพทย์ และ สมาคมกีฬาฟุตบอลแห่งประเทศไทย ในพระบรมราชูปถัมภ์ ในการตรวจเชื้อให้กับสโมสรสมาชิก และผู้ที่เกี่ยวข้อง โดยสมาคมกีฬาฟุตบอลแห่งประเทศไทยฯ เป็นผู้ดำเนินการออกค่าใช้จ่ายให้ทั้งหมด

สำหรับการตรวจหาเชื้อโควิด-19 ก่อนทำการแข่งขันฟุตบอล ไทย วีเมนส์ ลีก ในวันดังกล่าวประกอบไปด้วยณ ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ประจำจังหวัด 15 แห่งทั่วประเทศ ประกอบด้วย เชียงใหม่, เชียงราย, พิษณุโลก, นนทบุรี (กระทรวงสาธารณสุข) , ชลบุรี, อุดรธานี , อุบลราชธานี, นครสวรรค์ , สมุทรสงคราม , ขอนแก่น, นครราชสีมา, สุราษฎร์ธานี , สงขลา , ภูเก็ต และ ตรัง โดยแบ่งออกเป็นดังนี้

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที่ 1/1 (เชียงราย) ประกอบด้วย สโมสร โรงเรียนกีฬาจังหวัดลำปาง จำนวนโดยประมาณ 28 คน

สถาบันวิจัยวิทยาศาสตร์สาธารณสุข (นนทบุรี) ประกอบด้วย ทีมงานผู้ตัดสิน, นักเตะและบุคลากรจากสโมสร ราชประชา, สโมสร เกษมบัณฑิต เอฟซี, สโมสร บีเอสแอล, สโมสร พราม แบงค็อก ยูไนเต็ด และ สโมสร โรงเรียนกีฬากรุงเทพมหานคร จำนวนโดยประมาณ 260 คน

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที่ 5 (สมุทรสงคราม) ประกอบด้วยสโมสรทวีวัฒนา สมุทรสาคร ยูไนเต็ด และ สโมสรโรงเรียนเฉลิมพระเกียรติ สมุทรสาคร จำนวนโดยประมาณ 60 คน

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที่ 6 (ชลบุรี) ประกอบด้วย สโมสรสมาคมกีฬาฟุตบอลชลบุรี จำนวนโดยประมาณ 25 คน

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที่ 7 (ขอนแก่น) ประกอบด้วย สโมสรฟุตบอลขอนแก่นซิตี้ จำนวนโดยประมาณ 30 คน

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที่ 9 (นครราชสีมา) ประกอบด้วยสโมสรลพบุรี ซิตี้, สโมสรบีอาร์ยู บุรีราษฎร์ อะคาเดมี และ สโมสรหินโคน ยูไนเต็ด จำนวนโดยประมาณ 86 คน

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที่ 10 (อุบลราชธานี) ประกอบด้วย สโมสรโนนขาม เดชอุดม ยูไนเต็ด, สโมสรไทเกอร์ คิดส์ มุกดาหาร ยูไนเต็ด จำนวนโดยประมาณ 60 คน

ศูนย์วิทยาศาสตร์การแพทย์ที่ 11 (สุราษฎร์ธานี) ประกอบด้วย สโมสรเอ็มเอช นครศรี เอฟซี จำนวนโดยประมาณ 30 คน

ทั้งนี้ หากนักกีฬาหรือบุคลากรที่มีผลการตรวจพบว่าไม่ผ่านการตรวจหาเชื้อไวรัสโควิด -19 จะไม่มีสิทธิ์ลงทำการแข่งขันจนกว่าผลตรวจจะเป็นลบ เพื่อเป็นการป้องกันการแพร่ระบาดของโควิด-19

โดยการแข่งขันฟุตบอลหญิง ไทย วีเมนส์ ลีก จะเริ่มต้นที่รอบคัดเลือก โดยแบ่งออกเป็น 4 กลุ่ม กลุ่ม ละ 4 ทีม และแข่งขันแบบพบกันหมดภายในกลุ่ม ทีมแชมป์ จะได้สิทธิ์ผ่านเข้าร่วมการแข่งขันในระดับ Division 1, ส่วนทีมอันดับ 2 และ 3 ของแต่ละกลุ่ม จะได้สิทธิ์เข้าร่วมการแข่งขันในระดับ Division 2 ขณะที่ทีมอันดับสุดท้ายของแต่ละกลุ่มจะไม่ได้สิทธิ์เข้าร่วมการแข่งขันฤดูกาล 2020/21

สำหรับ การแข่งขันฟุตบอลลีกหญิงจะแข่งขันรอบคัดเลือกจะจัดขึ้นในวันที่ 19,20,30 กันยายน 2563 และ วันที่ 1,3,4 ตุลาคม 2563 ซึ่งการจัดการแข่งขันฟุตบอลไทยวีเมนส์ลีก และ ไทยวีเมนส์ลีก ดิวิชั่น 2 จะเริ่มแข่งขันในวันที่ 31 ตุลาคม 2563 – 27 มีนาคม 2564